南京艾德加生物制药科技有限公司的前身是南京京华生物工程有限公司,创建于1997年,而后企业通过发展后认定为高新技术企业。2008年至2018年再次通过省高新技术企业认定,并获得市青年文明号、区重点保护单位等称号。
2019年,公司重组为南京艾德加生物制药科技有限公司,采用MAH药品持有人与自主研发双驱动模式,促进创新药和高级专利仿制药的产业化发展。